O Museu de Aveiro reabriu em Dezembro de 2008 após profundas obras de requalificação.

Os trabalhos, orçados em cinco milhões de euros, ainda estão por terminar. Uma tarefa que o Presidente do Instituto dos Museus e da Conservação, João Brigola, espera dar andamento, aproveitando verbas comunitárias que ainda estejam disponíveis. "Não tem decorrido tão bem como desejaríamos mas, esta obra tem de ir até ao fim apesar de ter um caderno de encargos pesado, existindo questões complexas por resolver, de ordem técnica, financeira e orçamental e os tempos hoje não correm a favor das grandes obras mas o Museu de Aveiro está contemplado nessa orçamentação".

Depois da intervenção no edifício, seguindo o projecto do arquitecto Alcino Soutinho, falta a conservação da área monumental do Museu de Aveiro, conhecida como a zona do antigo convento.